Passado um bom tempo sem postar, encontrei dois links interessantes sobre esse assunto que muita gente gostaria que fosse resolvido.
As soluções não fazem com que o Internet Explorer 6 tenha suporte completo à PNGs transparentes, porém minimizam o suporte incompleto.
Seguem os links:
Espero que seja útil esses links. Caso tenha alguma outra solução, por favor comente.